助理教授,课题组PI,博士生导师 系统生物学系 课题组网站
郑梅珍本科毕业于华中科技大学同济医学院,暨南大学取得生物化学与分子生物学硕士学位,中山大学附属肿瘤防治中心取得博士学位。随后主要在新加坡基因组中心(GIS)、美国杰克逊实验室基因组医学中心(The Jackson Laboratory For Genomic Medicine)进行博士后、副研究员等工作。主要致力于单细胞、单分子空间基因组交互作用的技术开发与应用。2019年底加入南方科技大学生物系,任助理教授,课题组PI,博士生导师。
深圳市国家级领军人才
实验室项目
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国家自然科学基金 (面上)
广东省自然基金委会 (面上)
深圳市科技创新委员会(面上)
国家科技部 (国家重点研发计划)
个人简介
研究领域
1. 单细胞、单分子染色质交互作用技术研发及应用
2. 全基因组RNA-染色质DNA交互作用技术研发及应用
3. RNA介导的三维基因组空间结构及其转录调控机制
4. 多组学技术在宿主互作、肿瘤、免疫等领域中的应用
教学
基因组学 (本科)
空间基因组学(研究生)
学术成果 查看更多
◆ Corresponding author research papers:
1. Simon Zhongyuan Tian*†, Yang Yang†, Duo Ning†, Ke Fang†, Kai Jing, Guangyu Huang, Yewen Xu, Pengfei Yin, Haibo Huang, Gengzhan Chen, Yuqing Deng, Shaohong Zhang, Zhimin Zhang, Zhenxia Chen, Tong Gao, Wei Chen, Guoliang Li, Ruilin Tian, Yijun Ruan*, Yiming Li*, Meizhen Zheng*. “3D chromatin structures associated with ncRNA roX2 for hyperactivation and coactivation across the entire X chromosome”. Science Advances, 10 (2024): eado5716.
2. Kai Jing, Yewen Xu, Yang Yang, Pengfei Yin, Duo Ning, Guangyu Huang, Yuqing Deng, Gengzhan Chen, Guoliang Li, Simon Zhongyuan Tian* and Meizhen Zheng*. “ScSmOP: A Universal Computational Pipeline for Single-Cell Single-Molecule Multiomics Data Analysis”. Briefings in Bioinformatics, 6 (2023): bbad343.
3. Simon Zhongyuan Tian*, Guoliang Li, Duo Ning, Kai Jing, Yewen Xu, Yang Yang, Melissa J. Fullwood, Pengfei Yin, Guangyu Huang, Dariusz Plewczynski, Jixian Zhai, Ziwei Dai, Wei Chen* and Meizhen Zheng*. “MCIBox: a toolkit for single-molecule multi-way chromatin interaction visualization and micro-domains identification”. Briefings in Bioinformatics, 23 (2022): bbac380.
4. Simon Zhongyuan Tian*, Pengfei Yin, Kai Jing, Yang Yang, Yewen Xu, Guangyu Huang, Duo Ning, Melissa J. Fullwood* and Meizhen Zheng*. “MCI-frcnn: A Deep Learning Method for Topological Micro-Domain Boundary Detection”. Front cell Dev Boil, 10 (2022): 1050769
◆ First author research papers:
5. Meizhen Zheng, Simon Zhongyuan Tian, Daniel Capurso, Minji Kim, Rahul Maurya, Byoungkoo Lee, Emaly Piecuch, Liang Gong, Jacqueline Jufen Zhu, Zhihui Li, Chee Hong Wong, Chew Yee Ngan, Ping Wang, Xiaoan Ruan, Chia-Lin Wei & Yijun Ruan. Multiplex Chromatin Interaction Analysis with Single-Molecule Precision. Nature. 2019, 556:558-562.
6. M.Z. Zheng, L.M. Zheng and Y.X. Zeng. SCC-112 gene is involved in tumor progression and promotes the cell proliferation in G2/M phase. J Cancer Res Clin Oncol. 2008 Apr; 134(4): 453-62.
7. Meizhen Zheng, Haide Qin, Ruhua Zhang, Xingjuan Yu, Lizhen Chen, Qisheng Feng, Yixin Zeng. Haplotype of gene Nedd4 binding protein 2 associated with sporadic Nasopharyngeal carcinoma in the Southern Chinese population. J Transl Med. 2007 Jul 13; 5:36.
8. Zheng, MZ; Jiang, JW. Progress in unmethylated immunostimulatory oligodeoxynucletides. Progress In Biochemistry And Biophysics. 2003,30(2):190-193.
◆ Co-author research papers (selected):
9. The 4D nucleome project. The 4D Nucleome Network, Nature. 2017 Sep 13; 549(7671): 219–226.
10. Xingwang Li,Oscar Junhong Luo,Ping Wang, Meizhen Zheng, Danjuan Wang, Emaly Piecuch, Jacqueline Jufen Zhu,Simon Zhongyuan Tian,Zhonghui Tang,Guoliang Li & Yijun Ruan. Long-read ChIA-PET for base-pair-resolution mapping of haplotype-specific chromatin interactions. Nature Protocol. 2017,12:899-915.
11. Zhonghui Tang, Oscar Junhong Luo, Xingwang Li, Meizhen Zheng, Jacqueline Jufen Zhu, Przemyslaw Szalaj, Pawel Trzaskoma, Adriana Magalska, Jakub Wlodarczyk, Blazej Ruszczycki, Paul Michalski, Emaly Piecuch, Ping Wang, Danjuan Wang, Simon Zhongyuan Tian, May Penrad-Mobayed, Laurent M Sachs, Xiaoan Ruan, Chia-Lin Wei, Edison T Liu, Grzegorz M Wilczynski, Dariusz Plewczynski, Guoliang Li, Yijun Ruan. CTCF-Mediated Human 3D Genome Architecture Reveals Chromatin Topology for Transcription. Cell.2015, 163:1611-1627.
12. Guoliang Li, X. Ruan, K. A. Raymond, K. S. Sandhu, Meizhen Zheng, Ping Wang, Huay Mei Poh, Yufen Goh, Joanne Lim, Jingyao Zhang, Hui Shan Sim, Su Qin Peh, Fabianus Hendriyan Mulawadi, Chin Thing Ong, Yuriy L. Orlov, Shuzhen Hong, Zhizhuo Zhang, Steve Landt, Debasish Raha, Ghia Euskirchen, Chia-Lin Wei, Weihong Ge, Huaien Wang, Carrie Davis, Katherine Fisher, Ali Mortazavi, Mark Gerstein, Thomas Gingeras, Barbara Wold, Yi Sun, Melissa J. Fullwood, Edwin Cheung, Edison Liu, Wing-Kin Sung, Michael Snyder, Yijun Ruan. Extensive Promoter-centered Chromatin Interactions Provide a Topological Basis for Transcription Regulation. Cell. 2012 Jan 20;148 (1- 2):84-98.
13. ENCODE Project Consortium. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. Nature. 2012 Sep 6; 489(7414): 57-74.
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郑梅珍课题组致力于单细胞、单分子水平的3D基因组交互作用的技术开发与应用。我们已经开发了单分子精准的多重染色质交互作用技术(ChIA-Drop, Nature 2019)。目前正在开发单细胞、单分子多组学染色质交互作用技术(3Domics)。由于研究需要,课题组现招2名博士后,进行3Domics技术开发与疾病应用的研究工作。
【岗位名称】
“单细胞、单分子多组学”博士后
【岗位要求】
已获得生物学博士学位;博士课题与三维基因组学或高通量测序相关者优先考虑;
博士期间受过良好科研训练,以第一作者或共一作者发表过高水平论文;
有较强的英文表达及写作能力。
【工作内容】
开发“单细胞、单分子多重染色质交互作用技术(3Domics)”
【应聘者将以下材料发至Email: zhengmz@sustech.edu.cn】
个人简历;
论文代表作;
【博士后薪酬待遇及聘期_南方科技大学】:
(1)博士后聘用期两年,年薪33万元起,含广东省生活补贴15万元(税前)及深圳市生活补贴6万元(税前),并按深圳市有关规定参加社会保险及住房公积金。博士后福利费参照学校教职工标准发放。
(2)特别优秀候选人可以申请校长卓越博士后,年薪可达50万元以上。(含广东省及深圳市在站生活补贴)。
(3)在站期间,可依托学校申请深圳市公租房,未依托学校使用深圳市公租房的博士后,可享受两年税前2800元/月的住房补贴。
(4)拥有优良的工作环境和境内外合作交流机会,博士后在站期间享受两年共计2.5万学术交流经费资助。
(5)课题组协助符合条件的博士后申请博士后人才项目。如成功申请,最高可享受总计100万元补贴(与广东省及深圳市在站博士后生活补贴不同时享受)。
(6)博士后出站选择留深从事科研工作,且与本市企事业单位签订3年以上劳动(聘用)合同的,可以申请深圳市博士后留深来深科研资助。深圳市政府给予每人每年10万元科研资助,共资助3年(以深圳市最新申报要求为准)。
(7)根据《深圳市新引进博士人才生活补贴工作实施办法》规定,新引进博士人才生活补贴(10万元)与省市博士后在站生活补贴不同时享受。