宋毅

助理教授 |生命科学学院, 生物系

2021年10月入职南方科技大学生物系任助理教授,入职首年度获批国自然面上项目,深圳市稳定支持等项目资助,2024年度深圳市优青项目入选者。在Nature Plants,iMeta等期刊发表研究和综述文章多篇。担任Nature communications, ISME J, New phy和Molecular Plant等多个期刊审稿人,担任担任Molecular Plant-Microbe Interactions期刊编委(Associated Editor)。应邀在中国微生物学会微生物组专业委员会成立大会等会议做邀请报告十余次。

 

个人简介

个人介绍:

2017年博士毕业于复旦大学生物化学与分子生物学系,2017至2021年在英属哥伦比亚大学微生物与免疫系开展博士后研究,2021年10月入职南方科技大学生物系任助理教授,深圳市鹏城孔雀人才项目入选者。课题组主要关注根系与病原菌和益生菌互作机制,以及根系塑造微生物组从而提升自身适应性的生理生态学机制。现主持国家自然科学基金面上项目,深圳市科创委稳定支持面上项目各一项。相关研究成果发表在Nature Plants等期刊,担任Frontiers in Microbiology和Frontiers in plant science审稿编辑。

高等生物广泛与所依附的微生物群体形成共生关系,且微生物组显著影响宿主的生长、代谢和环境适应性。宿主与微生物组互作的机制研究是现代生命科学的前沿和热点方向之一。前期工作将正向遗传学筛选手段引入根系和微生物组互作的研究中,筛选出能够相对特异性调控根系益生菌定殖的关键调控因子FER(Nature Plants, 2021)。后续将综合使用分子遗传学和微生物组学技术手段,进一步开展根系免疫调控机制以及根系塑造/重塑微生物组的机制研究。并将进一步探究微生物组对宿主环境适应性的影响和应用潜力。

研究领域:

1.根系免疫调控机制以及根系塑造/重塑微生物组的机制研究。

2.植物微生物组对于植物逆境适应性的影响及其分子机制;

3.益生菌根系定殖的机制;

工作经历:

2021年10月至今          南方科技大学      助理教授

2017年10月至2021年9月 英属哥伦比亚大学  博士后

学习经历:

2012年9月至2017年7月 复旦大学 硕博连读

2008年9月 至 2012年7月  安徽农业大学  本科

所获荣誉:

复旦大学优秀毕业生 (2017)

安徽省优秀毕业生 (2012)

代表文章:

1. Song Y, Wilson A J, Zhang X C, et al. FERONIA restricts Pseudomonas in the rhizosphere microbiome via regulation of reactive oxygen species[J]. Nature plants, 2021, 7(5): 644-654.

(Highlighted in Molecular Plant/ Editor’s Highlight:FERONIA-Goddess Receptor in Plants)

2. Song Y, Haney C H. Drought dampens microbiome development[J]. Nature Plants, 2021, 7(8): 994-995.

3. Song Y, Zhang X C, Qiu Y, et al. A screen for mutants deficient in coronatine-mediated suppression of root immunity identifies Arabidopsis SDA1 as a novel integrator of immunity and phytohormone signaling[J]. bioRxiv, 2021.

4. Socha A, Song Y, Ross B, et al. Natural variation in Arabidopsis ISR1 affects iron localization and induced systemic resistance[J]. bioRxiv, 2021.

5. Song Y, Yang C, Gao S, et al. Age-triggered and dark-induced leaf senescence require the bHLH transcription factors PIF3, 4, and 5[J]. Molecular plant, 2014, 7(12): 1776-1787.

6. Song Y, Jiang Y, Kuai B, et al. CIRCADIAN CLOCK-ASSOCIATED 1 inhibits leaf senescence in Arabidopsis[J]. Frontiers in Plant Science, 2018, 9: 280.

7. Song Y, Zhang Z, Tan X, et al. Association of the molecular regulation of ear leaf senescence/stress response and photosynthesis/metabolism with heterosis at the reproductive stage in maize[J]. Scientific reports, 2016, 6(1): 1-12.

8. Song Y, Qiu K, Gao J, et al. Molecular and physiological analyses of the effects of red and blue LED light irradiation on postharvest senescence of pak choi[J]. Postharvest Biology and Technology, 2020, 164: 111155.

研究领域

课题组常年欢迎博士后加入,希望候选人具有植物或微生物分子生物学,生物信息学技能之一。课题组视博士后为独立合作伙伴,对于表现优异的申请人,愿意承诺以共同通讯作者发表研究论文(已有两份手稿课题组博士后为并列通讯)。

 

宿主与微生物组互作的机制研究是现代生命科学的前沿和热点方向之一,也是农业微生物组领域的基础科学问题。前期工作将正向遗传学筛选手段引入根系和微生物组互作的研究中,筛选出能够相对特异性调控根系益生菌定殖的关键调控因子FER(Nature Plants, 2021)。后续将综合使用分子遗传学和微生物组学技术手段,进一步开展根系免疫调控机制以及根系塑造/重塑微生物组的机制研究。在此过程中,解析宿主核心微生物组提升宿主适应性的生理生态学和分子生物学机制,旨在推进根系生态学从传统的数据分析领域深入到遗传机制水平。


教学

教授研究生《高级植物免疫学》,3学分,48学时

 

应邀报告:

 

4. 2023-11 中国微生物学会微生物组专业委员会成立大会暨微生物组与健康学术论坛 (深圳)

3. 2023-05 中国肠道大会 (北京)

2. 2022-09 第四届青年生命科学论坛(广州)

1.2022-04-11 南京农业大学 LORE talk

https://www.bilibili.com/video/BV1Me411578X/


学术成果 查看更多

11. Zhenghong Wang, et al., ……, Yi Song*. Root hair developmental regulators orchestrate drought triggered microbiome changes and the interaction with beneficial Rhizobiaceae. Nature communications. 2024, accepted 

10. Qiuhua Yang, Zhuowen Li, Kaixiang Guan, et al, Yi Song*. Comparative single-nucleus RNA-seq analysis captures shared and distinct responses to beneficial and pathogenic microbes in roots. bioRxiv. 2023

9. Zhenghong Wang, Yi Song. Toward understanding the genetic bases underlying plant‐mediated “cry for help” to the microbiota. iMeta e8,(2022). http://dx.doi.org/10.1002/imt2.8

8. Song Y, Wilson A J, Zhang X C, et al. FERONIA restricts Pseudomonas in the rhizosphere microbiome via regulation of reactive oxygen species[J]. Nature plants, 2021, 7(5): 644-654.

(Highlighted in Molecular Plant/ Editor’s Highlight:FERONIA-Goddess Receptor in Plants)

7. Song Y, Haney C H. Drought dampens microbiome development[J]. Nature Plants, 2021, 7(8): 994-995.

6.Song Y, Zhang X C, Qiu Y, et al. A screen for mutants deficient in coronatine-mediated suppression of root immunity identifies Arabidopsis SDA1 as a novel integrator of immunity and phytohormone signaling[J]. bioRxiv, 2021.

5.Socha A, Song Y, Ross B, et al. Natural variation in Arabidopsis ISR1 affects iron localization and induced systemic resistance[J]. bioRxiv, 2021.

4.Song Y, Yang C, Gao S, et al. Age-triggered and dark-induced leaf senescence require the bHLH transcription factors PIF3, 4, and 5[J]. Molecular plant, 2014, 7(12): 1776-1787.

3.Song Y, Jiang Y, Kuai B, et al. CIRCADIAN CLOCK-ASSOCIATED 1 inhibits leaf senescence in Arabidopsis[J]. Frontiers in Plant Science, 2018, 9: 280.

2.Song Y, Zhang Z, Tan X, et al. Association of the molecular regulation of ear leaf senescence/stress response and photosynthesis/metabolism with heterosis at the reproductive stage in maize[J]. Scientific reports, 2016, 6(1): 1-12.

1.Song Y, Qiu K, Gao J, et al. Molecular and physiological analyses of the effects of red and blue LED light irradiation on postharvest senescence of pak choi[J]. Postharvest Biology and Technology, 2020, 164: 111155.

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