帅世民

副教授 |医学院, 人类细胞生物和遗传学系   课题组网站

帅世民,南方科技大学医学院副教授、博士生导师,国家“四青”人才、深圳市国家级领军人才。2014年本科毕业于浙江大学生命科学学院,2019年博士毕业于多伦多大学分子遗传学系和安大略省癌症研究所(OICR),后赴欧洲分子生物学实验室海德堡总部(EMBL-Heidelberg)和欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)进行由欧盟玛丽·居里学者(MSCA)项目联合资助的博士后研究(EIPOD4),并于2021年秋季全职回国组建计算组学(Computational Omics,COmics)实验室。主要从事计算生物学、生物信息学、基因组学等领域的研究。其与癌症基因组学、计算组学工具研发等相关的研究成果发表在了Nature及其子刊上,相关论文总被引超过1000次,h-index为10(Google Scholar,2021年9月)。

个人简介

帅世民,南方科技大学医学院副教授、博士生导师。2014年本科毕业于浙江大学生命科学学院,2019年博士毕业于多伦多大学分子遗传学系和安大略省癌症研究所(OICR),后赴欧洲分子生物学实验室海德堡总部(EMBL-Heidelberg)和欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)进行由欧盟玛丽·居里学者(MSCA)项目联合资助的博士后研究(EIPOD4),并于2021年秋季全职回国组建计算组学(Computational Omics,COmics)实验室。主要从事计算生物学、生物信息学、基因组学等领域的研究。其与癌症基因组学、计算组学工具研发等相关的研究成果发表在了Nature及其子刊上,相关论文总被引超过1000次,h-index为10(Google Scholar,2021年9月)。

研究领域

1. 生物信息学和计算生物学

2. 全尺度遗传变异与人类疾病的关联分析

3. 癌症基因组学和癌症生态系统研究

4. 多组学数据分析与新型组学数据分析工具研发


学术成果 查看更多

发表论文:

1.      Shuai S*, PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group, Gallinger S, Stein LD* & PCAWG Consortium (2020) Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower. Nat. Commun. 11: 734–734

2.      Shuai S, Suzuki H, Diaz-Navarro A, Nadeu F, Kumar SA, Gutierrez-Fernandez A, Delgado J, Pinyol M, López-Otín C, Puente XS, Taylor MD, Campo E & Stein LD (2019) The U1 spliceosomal RNA is recurrently mutated in multiple cancers. Nature 574: 712–716

3.      Rheinbay E, Nielsen MM, Abascal F, Wala JA, Shapira O, Tiao G, Hornshøj H, Hess JM, Juul RI, Lin Z, Feuerbach L, Sabarinathan R, Madsen T, Kim J, Mularoni L, Shuai S, Lanzós A, Herrmann C, Maruvka YE, Shen C, et al (2020) Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes. Nature 578: 102–111

4.      Zhu H, Uusküla-Reimand L, Isaev K, Wadi L, Alizada A, Shuai S, Huang V, Aduluso-Nwaobasi D, Paczkowska M, Abd-Rabbo D, Ocsenas O, Liang M, Thompson JD, Li Y, Ruan L, Krassowski M, Dzneladze I, Simpson JT, Lupien M, Stein LD, et al (2020) Candidate Cancer Driver Mutations in Distal Regulatory Elements and Long-Range Chromatin Interaction Networks. Mol. Cell 77: 1-15

5.      Suzuki H, Kumar SA, Shuai S, Diaz-Navarro A, Gutierrez-Fernandez A, De Antonellis P, Cavalli FMG, Juraschka K, Farooq H, Shibahara I, Vladoiu MC, Zhang J, Abeysundara N, Przelicki D, Skowron P, Gauer N, Luu B, Daniels C, Wu X, Forget A, et al (2019) Recurrent noncoding U1 snRNA mutations drive cryptic splicing in SHH medulloblastoma. Nature 574: 707–711

6.      Feigin ME, Garvin T, Bailey P, Waddell N, Chang DK, Kelley DR, Shuai S, Gallinger S, McPherson JD, Grimmond SM, Khurana E, Stein LD, Biankin AV, Schatz MC & Tuveson DA (2017) Recurrent noncoding regulatory mutations in pancreatic ductal adenocarcinoma. Nat. Genet. 49: 825–833

7.      ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium [including Shuai S] (2020) Pan-cancer analysis of whole genomes. Nature 578: 82–93

8.      Carlevaro-Fita J, Lanzós A, Feuerbach L, Hong C, Mas-Ponte D, Pedersen JS, PCAWG Drivers and Functional Interpretation Group [including Shuai S], Johnson R & PCAWG Consortium (2020) Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis. Communications biology 3: 56–56

9.      Paczkowska M, Barenboim J, Sintupisut N, Fox NS, Zhu H, Abd-Rabbo D, Mee MW, Boutros PC, PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group [including Shuai S], Reimand J & PCAWG Consortium (2020) Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data. Nat. Commun. 11: 735–735

10.  Reyna MA, Haan D, Paczkowska M, Verbeke LPC, Vazquez M, Kahraman A, Pulido-Tamayo S, Barenboim J, Wadi L, Dhingra P, Shrestha R, Getz G, Lawrence MS, Pedersen JS, Rubin MA, Wheeler DA, Brunak S, Izarzugaza JMG, Khurana E, Marchal K, et al, PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group [including Shuai S], Reimand J, Stuart JM, Raphael BJ & PCAWG Consortium (2020) Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes. Nat. Commun. 11: 729–729

加入团队

帅世民课题组主要从事计算生物学、生物信息学、基因组学等领域的研究。
诚聘2名博士后、1名科研助理。实验室同时面向全国招收博士研究生(直博、有意读博的硕士研究生),有意向报考南科大医学院的同学亦可发邮件咨询。我们也欢迎对COmics实验室感兴趣的优秀本科生前来实习。  
博士后/Postdoctoral Fellow(2名)  
(一) 应聘条件 
1. 已获得或即将获得计算生物学、生物信息学、计算机科学、统计学等定量科学领域,或有生物信息学知识的生物学、医学等相关领域的博士学位,年龄不大于35周岁;  
2. 擅长至少一种常用的编程语言(R、Python、C、Java等);  
3. 以第一或通讯作者(含共同)身份在相关领域发表过至少一篇SCI论文;  
4. 拥有以下经验的申请人优先:组学大数据分析、三代测序数据分析、云计算、高性能计算集群(HPC)使用、基因组结构变异分析、单细胞测序分析、空间组学分析、统计遗传学分析、癌症基因组学分析等;  
5. 在导师指导下独立完成研究课题,课题组鼓励支持博士后自主构思开发新研究方向; 
6. 具备较好的学习能力,英语读写沟通能力以及团队协作能力。 
 (二) 岗位待遇  
1. 博士后聘用期两年,年薪33万元起,含广东省生活补贴15万元及深圳市生活补贴6万元,并按深圳市有关规定参加社会保险及住房公积金。博士后福利费参照学校教职工标准发放。  
2. 特别优秀候选人可以申请校长卓越博士后,年薪可达50万元以上。(含广东省及深圳市在站生活补贴)。  
3. 在站期间,可依托学校申请深圳市公租房,未依托学校使用深圳市公租房的博士后,可享受两年税前2800元/月的住房补贴。  
4. 拥有优良的工作环境和境内外合作交流机会,博士后在站期间享受两年共计2.5万学术交流经费资助。  
5. 课题组协助符合条件的博士后申请“广东省海外青年博士后引进项目”。即在世界排名前200名的高校(不含境内,排名以上一年度泰晤士、USNEWS、QS和上海交通大学的世界大学排行榜为准)获得博士学位,在广东省博士后设站单位从事博士后研究,并承诺在站2年以上的博士后,申请成功后省财政给予每名进站博士后资助60万元生活补贴(与广东省每年15万生活补贴不同时享受,与深圳市每年6万元生活补贴同时享受情况以深圳市规定为准);对获得本项目资助,出站后与广东省用人单位签订工作协议或劳动合同,并承诺连续在粤工作3年以上的博士后,省财政给予每人40万元住房补贴。  
6. 博士后出站选择留深从事科研工作,且与本市企事业单位签订3年以上劳动(聘用)合同的,可以申请深圳市博士后留深来深科研资助。深圳市政府给予每人每年10万元科研资助,共资助3年(以深圳市最新申报要求为准)。  
科研助理/Research Assistant(1名)  
(一) 应聘条件  
1. 本科及以上学历。责任心强,工作认真有效率,有出色团队合作精神。 
2. 拥有以下专业硕士学位的申请人优先:计算生物学、生物信息学、计算机科学、统计学等定量科学领域,或有生物信息学知识的生物学、医学等生命科学领域。  
3. 拥有以下经验的申请人优先:编程(R、Python、C/C++、Java等)、组学大数据分析、三代测序数据分析、云计算、高性能计算集群(HPC)使用、基因组结构变异分析、单细胞测序分析、空间组学分析、统计遗传学分析、癌症基因组学分析等;  
4. 主要协助实验室管理,课题申请,或在PI的指导下完成课题项目。  
(二) 岗位待遇  
基本薪资根据学历和经历面议,五险一金、各项福利、补贴等参照学校标准缴纳、发放。工作优秀者推荐读博。   
应聘流程  
我们欢迎所有符合条件的人申请。申请人请将个人简历(包括学习经历,工作或科研的经历,主要成就等)发送至以下邮箱:shuaism@sustech.edu.cn(标题请注明“应聘岗位-姓名”,如“应聘博士后-蒙多”)。博士后申请者请同时附上3位推荐人的姓名、职位以及联系方式(邮箱/电话)。对符合条件的应聘人我们将尽快安排视频面试。申请过程、结果及提交的申请材料将严格保密。  
截止日期  
本招聘公告长期有效,我们再次欢迎所有符合条件的人申请,并期待你的加盟!  
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