副教授 (研究员) |生命科学学院, 生物系

饶枫博士是南方科技大学生命科学学院生物系副教授,研究员。新加坡国立大学生物医学学士,南洋理工大学生物学博士,约翰-霍普金斯大学医学院博士后,加入南科大前任职北京生命科学研究所研究员。饶枫实验室(信使与代谢生理学实验室)主要研究细胞内新兴小分子信使的功能及其代谢酶的修饰调控通路, 同时探索疾病微环境中小分子信使如何参与神经与代谢和肿瘤组织的互调互作。作为第一或通讯作者在PNAS, Nature Communications 和 Molecular Cell 等权威杂志上发表研究论文 16 篇(JCR 一区 12 篇,通讯作者 7 篇)。成果多次被作为研究亮点点评或被F1000等推荐,被引用超过 1600 次(谷歌学者数据)。担任中国病理生理协会蛋白质修饰和疾病专委会秘书,中国神经科学学会离子通道与受体分会委员。 入选深圳市海外高层次人才计划和广东省珠江人才计划。

个人简介

学术论文:

    1. Luo Y, Su Y, Rao F*. Role of NEDD8 and neddylation dynamics in DNA damage response. Genome Instability & Disease 2021 139-149
    2. Lin H#, Yan Y#, Luo Y#, So WY#, Wei X, Zhang X, Yang X, Zhang J, Su Y, Yang X, Zhang B, Zhang KJ, Jiang N, Chow BKC, Han W, Wang F, and Rao F*. IP6-assisted CSN-COP1 competition regulates a CRL4-ETV5 proteolytic checkpoint to safeguard glucose-induced insulin secretion. Nat. Commun. 2021 12, 2461. https://doi.org/10.1038/s41467-021-22941-3
    3. Zhang X, Shi S, Su Y, Yang X, He S, Wu J, Zhang J, Rao, F.*. Suramin and NF449 are IP5K inhibitors that disrupt IP6-mediated regulation of cullin RING ligase and sensitize cancer cells to MLN4924/Pevonedistat. J. Biol. Chem. 2020 295,10281-10292.
    4. Lin H. #, Zhang X. #, Liu L.#, Fu QY., Zang CL., Ding Y., Xu ZX., He SN., Yang XL., Wei XY., Mao HB., Cui YS, Wei Yi., Zhou CZ., Du LL., Huang N., Zheng N., Wang T.*, and Rao F.*. Molecular basis of metabolite-dependent Cullin RING ligase deneddylation by the COP9 Siganalosome. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2020 117, 4117-24.(F1000 recommendation) (Commentary)
    5. Rao F.*, Lin H, Su Y.. Cullin RING ligase regulation by the COP9 Signalosome: Structural Mechanisms and New Physiologic Players. Adv. Exp. Med. Biol. 2020, 1217, 47-60. (Invited Chapter, book “Cullin RING Ligases and Neddylation”).
    6. Zhang X, Rao F.*. Are inositol polyphosphates the missing link in dynamic Cullin RING ligase regulation by the COP9 Signalosome? Biomolecules. "ZOMES" Special Issue: 2019, 9, 349.
    7. 魏文毅*、孙毅*、曹诚、常智杰、陈策实、陈佺、程金科、冯仁田、高大明、胡荣贵、贾立军、姜天霞、金建平、李汇华、李卫、刘翠华、饶枫、商瑜、宋质银、万勇、王平、王占新、吴缅、吴乔、谢旗、谢松波、谢志平、徐平、许执恒、杨波、阳成伟、应美丹、张宏冰、张令强、赵永超、周军、朱军、王琳芳、张宏、王琛、邱小波*. 类泛素蛋白及其中文命名(Ubiquitin-like Proteins and their Chinese Nomenclatures). 科学通报. 2018, 63(25):2564-2569.
    8. Fu C., Tyagi R., Chin AC., Rojas T., Li RJ., Guha P., Bernstein IA., Rao F., Xu R., Cha JY., Xu J., Snowman AM., Semenza GL., Snyder SH. Inositol Polyphosphate Multikinase Inhibits Angiogenesis via Inositol Pentakisphosphate-Induced HIF-1α [J]. Circ. Res. 2018 Feb 2, 122(3):457-472.
    9. Scherer PC., Zaccor NW., Neumann NM., Vasavda C., Barrow R., Ewald AJ., Rao F., Sumner CJ., Snyder SH. TRPV1 is a physiological regulator of μ-opioid receptors[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2017 Dec 19, 114(51):13561-13566.
    10. Scherer PC.#, Ding Y.#, Liu Z., Xu J., Mao H., Barrow JC., Wei N., Zheng N., Snyder SH*Rao F.*. Inositol hexakisphosphate(IP6) generated by IP5K mediates cullin-COP9 signalosome interactions and CRL function. Proc. Natl. Acad. Sci. USA2016, 113, 3503-8.
    11. Rao F.#Xu J.#, Fu C.#, Cha JY., Xu R., Gadalla MM., Wu M., Fiedler D., Barrow JC., Snyder SH. Inositol pyrophosphates promote cancer growth and metastasis by antagonizing the tumor suppressor LKB1. Proc. Natl. Acad. Sci. USA2015 112, 1773-8. (Highlighted by Chemistry & Biology)
    12. Rao F.#Xu J.#, Kahn AB., Cha J., Xu R. Tyagi R., Dang Y., Chakraborty A., Snyder SH. Inositol hexakisphosphate kinase-1 mediates assembly/ disassembly of the CRL4-Signalosome complex to regulate DNA repair and cell death. Proc. Natl. Acad. Sci. USA2014, 111, 16005-16010.
    13. Rao F., Cha J., Xu J., Xu R., Vandiver MS., Tokhunt RT., Wu M., Fiedler D., Barrow J., Snyder SH. Inositol pyrophosphates mediate the DNA-PK/ATM-p53 cell death pathway by regulating CK2 phosphorylation of Tti1/Tel2. Mol. Cell. 2014, 54, 119-32.
    14. Tan E.#Rao F.#, Pasunooti S., Pham TH., Soehano I., Turner MS., Liew CW., Lescar J., Pervushin K., Liang Z-X.  Solution structure of the PAS domain of a thermophilic YybT homolog reveals a potential ligand-binding site. J. Biol. Chem. 2013, 288:11949-59.
    15. Xu R., Sen N., Paul BD., Rao F., Vandiver MS., Snyder SH. Inositol phosphate multikinase catalyzes the acetylation of p53 by p300, thereby functioning as a p53 transcriptional co-activator. Sci. Signal. 2013, 6, ra22: 1-10.
    16. Vandiver MS., Paul BD., Xu R., Karuppagounder S., Rao F., Snowman AM., Ko HS., Li YI., Sen N., Dawson VL., Dawson TM., Snyder SH. Sulfhydration mediates neuroprotective actions of Parkin. Nat. Commun. 2013, 4:1626.
    17. Xu R, Paul BD, Smith DR, Tyagi R, Rao F., Khan AB., Blech DJ., Vandiver MS., Harraz MM., Guha P., Ahmed I., Sen N., Gallagher M., Snyder SH. Inositol polyphosphate multikinase is a transcriptional coactivator required for immediate early gene induction. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2013, 6, 110, 16181-.
    18. Cha J., Xu J., Paul BD., Rao F., Ho G., Snyder SH. Dexras1 Mediates adipogenesis and diet-induced obesity. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2013, 110, 20575-.
    19. Rao F., Wang T., Li M., Li Z., Hong N., Zhao H., Yan Y., Lu W., Chen T., Wang W., Lim M., Yuan Y., Liu L., Zeng L., Wei Q., Guan G., Li C., Hong Y. Medaka tertproduces multiple variants with differential expression during differentiation in vitro and in vivo Int. J. Biol. Sci2011, 7(4):426-439.
    20. Rao F., Ji Q., Soehano I., Liang Z-X. Unusual Heme-Binding PAS Domain from YybT Family Proteins. J. Bacteriol. 2011, 193:1543-1551.
    21. Rao F., See RY., Zhang D., Toh DC., Liang Z-X. YybT is a signaling protein that contains a cyclic-di-nucleotide phosphodiesterase domain and a GGDEF domain with ATPase activity. J. Biol. Chem. 2010, 285:473-82.
    22. Rao F.*, Qi Y., Murugan E., Pasunooti S., Ji Q.. 2’,3’-cAMP hydrolysis by metal-dependent phosphodiesterases containing DHH, EAL, and HD domains is non-specific: implications for PDE screening. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010, 398:500-505.
    23. Rao F., Pasunooti S., Ng Y., Zhuo W., Lim L., Liu AW., Liang Z-X. Enzymatic synthesis of c-di-GMP using a thermophilic diguanylate cyclase. Anal. Biochem. 2009, 389:138-42.
    24. Rao F., Qi Y., Chong HS., Kotaka M., Li B., Lescar J., Tang K., Liang Z-X. The functional role of a conserved loop in EAL domain-based c-di-GMP specific phosphodiesterase. J. Bacteriol. 2009, 191:4722-31. (Commentary: 191:4697-700).
    25. Rao F., Yang Y., Qi Y., Liang Z-X. Catalytic mechanism of C-di-GMP specific phosphodiesterase: a study of the EAL domain containing protein RocR from Psudomonas aeruginosa. J. Bacteriol. 2008, 190:3622-31. (F1000  recommendation)
    26. Chia WS., Chia, XD., Rao F., Bar-Nun S., Geifman S. ATP binding to p97/VCP regulates selective recruitment of adaptors to its proximal N-domain. PLOS ONE. 2012, 7: e50490.
    27. Chen M.W., Kotaka M., Vonrhein C., Bricogne G., Rao F., Chuah M.L., Svergun D., Schneider G., Liang Z-X. and Lescar J. Structural insights into the regulatory mechanism of the response regulator RocR from Pseudomonas aeruginosa in cyclic di-GMP signaling. J. Bacteriol. 2012, 194:4837-4846. (Front cover).
    28. Qi Y., Rao F., Luo Z., Liang Z- X. A flavin cofactor-binding PAS domain regulates C-di-GMP synthesis in AxDGC2 from Acetobacter xylinumBiochemistry. 2009, 48:10275-85.
    29. Kotaka M.*., Dutta S., Lee H.C., Lim M., Wong Y., Rao F., Mitchell E.P., Liang Z-X, Lescar JX. Expression, purification and preliminary crystallographic analysis of Pseudomonas aeruginosaRocR protein. Acta. Crystallogr. F. 2009, 65: 1035-1038.
    30. Murugan E., Kong R., Sun H., Rao F., Liang, Z-X. Expression, purification and characterization of acyl carrier protein phosphodiesterase from Pseudomonas aeruginosaProtein Expres. Purif. 2010, 71:132-138.

    (*= Corresponding Author; #=Co-first Author

研究领域

一,焦磷酸肌醇(IP7)代谢小分子的信使功能机制研究 (图一)

G蛋白偶联受体(GPCR)信号转导通路的新型第二信使三磷酸肌醇(IP3)能被一系列的肌醇激酶进一步磷酸化生成多种多磷酸肌醇(IP4-8),其功能了解不多。其中,能量高,不稳定的焦磷酸肌醇(IP7/8)的作用原理尤为难解。我们之前发现IP7是肿瘤细胞里调控凋亡和转移的命运抉择开关,在早期通过促凋亡来抑制肿瘤发生,后期则通过诱导上皮细胞-间充质转换来促进肿瘤恶化与转移(Rao et al. Mol Cell, 2014, Rao et al. PNAS 2015)。但是,IP7在疾病微环境中所感应的上游信号不清楚。通过研究焦磷酸肌醇特异的合成和水解酶的催化及调控机制,我们着眼于在细胞和小鼠模型里发掘焦磷酸肌醇介导的生理过程(如代谢稳态和肿瘤转移),并揭示相关的信号转导通路。在此基础上,我们通过化学生物学和生物化学的方法寻找小分子的直接作用位点和作用模式,希望能够归纳出焦磷酸肌醇作用的普遍规律。基于焦磷酸肌醇在癌症等疾病发生过程中的作用,我们的机制和功能研究或可为治疗相关疾病提供新靶点。

二,CRL泛素连接酶的拟素化修饰的代谢调控与疾病(图二)

Cullin-RING ligase(CRL)家族泛素连接酶介导了总泛素化的 20%,在癌症和糖尿病等多种疾病中失调,是新兴治疗靶点。CRL 还是最近兴起的蛋白降解靶向联合体(PROTAC)小分子药物所倚仗的泛素连接酶。CRL被拟素化修饰激活,受去拟泛素化酶CSN 抑制。我们研究CRL拟素化的代谢分子调控路径,包括多磷酸肌醇小分子和营养 (Rao et al. PNAS, 2014; Scherer,…,Rao*. PNAS, 2016; Lin,…, Rao*. PNAS, 2020; Zhang,..., Rao*. JBC, 2020)。相关发现或可为研发靶向CRL的新路径和解决PROTAC耐药提供理论基础。


教学

生物化学II (新陈代谢),分子药理学,生命科学前沿进展讲座


学术成果 查看更多

(1)发现多磷酸肌醇(IP6、IP7)调控CRL泛素连接酶的拟素化修饰动态,为靶向疾病状态下CRL的活性失调提供新思路(Rao et al. PNAS, 2014; Scherer,…,Rao*. PNAS, 2016; Lin,…, Rao*. PNAS 2020, Zhang,…, Rao*. JBC 2020,Lin,…, Rao*. Nat. Commun. 2021)

(2)解析了焦磷酸肌醇(IP7)代谢小分子及其合成激酶IP6K2调控肿瘤细胞凋亡或转移的命运抉择的分子机制(Rao et al. Mol Cell, 2014, Rao et al. PNAS 2015)。

(3)首次鉴定出特异水解第二信使c-di-AMP的磷酸二酯酶,并解析了其信号转导机制(Rao et al.JBC 2010, Rao et al. J. Bacteriol. 2011, Tan#, Rao# et al. JBC 2013)。

(4)发明了生物酶大规模合成第二信使c-di-GMP的方法(专利:US8,859,237 B2; Rao et al. Anal. Biochem. 2009),解析了了c-di-GMP的水解酶的催化和调控机理(Rao et al. J. Bacteriol. 2008, Rao et al. J. Bacteriol. 2009;)。

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团队成员 查看更多

加入团队

课题组拟在近期招聘博士后1名,具体要求如下:

(1)已获得或即将获得生物学或医学或相关领域的博士学位;

(2)对科学研究具有浓厚的 兴趣,工作认真负责,科学研究态度严谨, 具有良好的团队合作精神;

【岗位待遇与福利】

1. 博士后年薪33.5万元左右,含广东省补助15万元(税前)及深圳市生活补助6万元(税后),并按深圳市有关规定参加社会保险及住房公积金。博士后福利费参照学校员额内教职工标准发放。

2. 特别优秀者可以申请校长卓越博士后,年薪可达41.5万元。(含广东省及深圳市补助)

3. 课题组提供优良的工作环境和境内外合作交流机会,博士后在站期间享受两年共计2.5万学术交流经费资助。

4. 课题组提供充足的科研支持,并协助博士后本人作为负责人申请中国博士后科学基金、国家自然科学基金及广东省、深圳市各级科研项目。

5. 课题组可协助符合条件的博士后申请“广东省海外青年博士后引进项目”。即在世界排名前200名的高校(不含境内,排名以上一年度泰晤士、USNEWS、QS和上海交通大学的世界大学排行榜为准)获得博士学位,在广东省博士后设站单位从事博士后研究,并承诺在站2年以上的博士后,申请成功后省财政给予每名进站博士后资助60万元生活补贴;对获得本项目资助,出站后与广东省用人单位签订工作协议或劳动合同,并承诺连续在粤工作3年以上的博士后,省财政给予每人40万元住房补贴。

6. 博士后出站选择留深从事科研工作,且与本市企事业单位签订3年以上劳动(聘用)合同的,可以申请深圳市博士后留深来深科研资助。深圳市政府给予每人每年10万元科研资助,共资助3年。

7. 对于符合最新《深圳市新引进人才租房和生活补贴》相关政策要求的博士后,落户深圳后,可协助申请深圳市一次性租房和生活补贴3万元(免税,自主网上申请)。

8. 依据自身符合的条件情况,在站或出站留深博士后可申请 "深圳市孔雀计划C类人才"或者"深圳市后备级人才",享受5年160万的奖励津贴(免税)(以深圳市最新相关人才申报要求为准)。

9. 对于优秀的出站博士后将积极推荐协助其申请南方科技大学研究助理教授等岗位。

有意者请发邮件至:raof@sustech.edu.cn

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