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侯圣伟,助理教授(副高),博士生导师,独立PI。2018年获得德国弗莱堡大学生物信息学博士学位,随后在南加州大学海洋环境生物学系进行博士后研究,2021年加入南方科技大学海洋科学与工程系。研究方向主要包括海洋微生物时空分布格局、微生物环境适应机制及其与元素循环的关系、宿主-病毒(尤其是藻病毒)相互作用及其生态效应等,旨在通过多组学手段和生物信息学挖掘研究海洋微生物对气候变化的响应和反馈机制。侯博士在The ISME J, PNAS, Environ Microbial, RNA Biol等国际高水平期刊已发表论文20余篇。担任Frontiers in Microbiology 客座编辑和Frontiers in Marine Science审稿编辑,也是Nature Microbiology, The ISME J, Microbiome, Nature Communications等杂志审稿人。

个人简介

侯圣伟,助理教授(副高),博士生导师,独立PI。2018年获得德国弗莱堡大学生物信息学博士学位,随后在南加州大学海洋环境生物学系进行博士后研究,2021年加入南方科技大学海洋科学与工程系。研究方向主要包括海洋微生物时空分布格局、微生物环境适应机制及其与元素循环的关系、宿主-病毒(尤其是藻病毒)相互作用及其生态效应等,旨在通过多组学手段和生物信息学挖掘研究海洋微生物对气候变化的响应和反馈机制。侯博士在The ISME J, PNAS, Environ Microbiol, RNA Biol等国际高水平期刊已发表论文20余篇。担任Frontiers in Microbiology 客座编辑和Frontiers in Marine Science审稿编辑,也是Nature Microbiology, The ISME J, Microbiome, Nature Communications等杂志审稿人。

 

教育背景

2018 博士,德国弗莱堡大学,生物信息学

2013 硕士,中国科学院水生生物研究所,分子遗传学

2009 学士,西南大学,生物技术

 

工作经历

2021 – 至今 助理教授,南方科技大学

2018 – 2021 博士后, 南加利福尼亚大学海洋环境生物学系

 

科研项目

1. Simons Collaboration on Computational Biogeochemical Modeling of Marine Ecosystems (CBIOMES), Simons Foundation, 2017-2022, 参与。

2. USC Microbial Observatory at the San Pedro Ocean Time series (SPOT), NSF & Moore Foundation, 1998-2022 , 参与。

3. Marine Microorganisms: Cultivation Methods for Improving their Biotechnological Applications (MaCuMBA), European Union, 2012-2016, 参与。

 

代表论著

注:# 共同作者

1. J. L. Weissman, S. Hou, J. A. Fuhrman. Estimating maximal microbial growth rates from cultures, metagenomes, and single cells via codon usage patterns. Proc Natl Acad Sci. 2021 Mar 23;118(12):e2016810118.

2. A. M. Long#S. Hou#, J. C. Ignacio‑Espinoza, and J. A. Fuhrman. Benchmarking microbial growth rate predictions from metagenomes. The ISME J. 2020: 1‑13.

3. S. Hou#, M. López‑Pérez#, U. Pfreundt, N. Belkin, K. Stüber, B. Huettel, R. Reinhardt, I. Berman‑Frank, F. Rodriguez‑Valera and W. R. Hess. Benefit from decline: The primary transcriptome of Alteromonas macleodii str. Te101 during Trichodesmium demise. The ISME J. 2018 Jan 15:1.

4. S. Hou, M. Brenes, A. M. Muro‑Pastor, W. R. Hess. CRISPR‑Cas systems in multicellular cyanobacteria. RNA Biol. 2018 Aug 15:1‑12.

5. X. Tan#S. Hou#, K. Song, J. Georg, S. Klähn, X. Lu, W. R. Hess. The Primary Transcriptome of the Fast‑Growing Cyanobacterium Synechococcus elongatus UTEX 2973. Biotechnol Biofuels. 2018 Aug 4;11:218.

6. J. E. Teikari#S. Hou#, M. Wahlsten, W. R. Hess and K. Sivonen. Comparative genomics of the Baltic Sea toxic cyanobacteria Nodularia spumigena UHCC 0039 and its response on varying salinity. Front Microbiology 2018 Mar 8;9:356.

7. S. Hou, U. Pfreundt, D. Miller, I. Berman‑Frank, W. R Hess. mdRNA‑Seq analysis of marine microbial communities from the northern Red Sea. Sci Rep. 2016 Oct 19;6:35470.

8. S. Hou, F. Zhou, S. Peng, H. Gao and X. Xu. The HetR‑binding site that activates expression of patA in vegetative cells is required for normal heterocyst patterning in Anabaena sp. PCC 7120. Sci Bull. 2015 Jan;60(2):192‑201.

 

学术与社会职位

1. 担任 Nature Microbiology, The ISME J, Microbiome, Nature Communications, Frontiers in Microbiology 等杂志审稿人。

2. 担任 Frontiers in Microbiology 客座编辑,Frontiers in Marine Science 审阅编辑。

研究领域

计算生物学,气候变化微生物学,微生物生态与进化


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代表论文

注:# 共同作者

1. J. L. Weissman, S. Hou, J. A. Fuhrman. Estimating maximal microbial growth rates from cultures, metagenomes, and single cells via codon usage patterns. Proc Natl Acad Sci. 2021 Mar 23;118(12):e2016810118.

2. A. M. Long#S. Hou#, J. C. Ignacio‑Espinoza, and J. A. Fuhrman. Benchmarking microbial growth rate predictions from metagenomes. The ISME J. 2020: 1‑13.

3. S. Hou#, M. López‑Pérez#, U. Pfreundt, N. Belkin, K. Stüber, B. Huettel, R. Reinhardt, I. Berman‑Frank, F. Rodriguez‑Valera and W. R. Hess. Benefit from decline: The primary transcriptome of Alteromonas macleodii str. Te101 during Trichodesmium demise. The ISME J. 2018 Jan 15:1.

4. S. Hou, M. Brenes, A. M. Muro‑Pastor, W. R. Hess. CRISPR‑Cas systems in multicellular cyanobacteria. RNA Biol. 2018 Aug 15:1‑12.

5. X. Tan#S. Hou#, K. Song, J. Georg, S. Klähn, X. Lu, W. R. Hess. The Primary Transcriptome of the Fast‑Growing Cyanobacterium Synechococcus elongatus UTEX 2973. Biotechnol Biofuels. 2018 Aug 4;11:218.

6. J. E. Teikari#S. Hou#, M. Wahlsten, W. R. Hess and K. Sivonen. Comparative genomics of the Baltic Sea toxic cyanobacteria Nodularia spumigena UHCC 0039 and its response on varying salinity. Front Microbiology. 2018 Mar 8;9:356.

7. S. Hou, U. Pfreundt, D. Miller, I. Berman‑Frank, W. R Hess. mdRNA‑Seq analysis of marine microbial communities from the northern Red Sea. Sci Rep. 2016 Oct 19;6:35470.

8. S. Hou, F. Zhou, S. Peng, H. Gao and X. Xu. The HetR‑binding site that activates expression of patA in vegetative cells is required for normal heterocyst patterning in Anabaena sp. PCC 7120. Sci Bull. 2015 Jan;60(2):192‑201.

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1. 生物信息学博士后

    课题组目前有两个生物信息学博士后位置空缺,拟开展研究方向包括:

        (1) 微生物组学相关生物信息学软件、数据库和计算流程的开发; 

        (2) 藻-菌/宿主-病毒相互作用机制的组学研究; 

        (3) 大洋和河口低氧区微生物生存机制及其介导的元素循环; 

        (4) 海洋微生物时空分布格局、多样性和适应性进化相关研究。

    更多岗位信息和薪资待遇请查看南科大海洋系发布的招聘信息

    有意者请将个人详细简历、研究小结和代表性论文发送至侯老师邮箱:housw@sustech.edu.cn,邮件标题以"应聘博士后+本人姓名+研究领域"命名。

 

2. 微生物学博士后

    目前课题组急需微生物学博士后一名,主要从事

        (1) 海洋低氧区微生物单细胞分选、分离/富集培养; 

        (2) 海洋微生物(含病毒)低氧环境代谢机制及其介导的元素循环。

    具有微生物学、分子生物学、藻类生物学、分子病毒学或生态学研究背景者优先考虑。

    薪资待遇请参考生物信息学博士后招聘信息有意者请将个人详细简历、研究小结和代表性论文发送至侯老师邮箱:housw@sustech.edu.cn。

 

3. 研究生

    欢迎对海洋微生物生态和生物信息学感兴趣的同学报考侯老师硕士和博士研究生。

 

4. 访问学生学者

    本实验室常年招收具有生物信息学基础的硕士生、博士生和研究学者来校访问,并提供丰厚的薪资补贴,欢迎来信咨询。

 

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