副教授 生物系

邓怿,副教授,博士生导师。1996年本科毕业于山东大学生物系,2002年于德国波鸿鲁尔大学(Ruhr-University Bochum)取得生物学博士学位,2003至2008年在美国国家卫生研究院(NICHD & NIDDK, NIH)从事博士后研究,主要进行细胞内囊泡运输方面的研究工作(合作导师 Dr . Cathy L. Jackson和Dr. Caroline C. Philpott)。2009至2011年在香港科技大学开展了细胞周期调控与衰老方面的研究 (合作导师 Prof. Randy YC Poon),2011-2012年在香港中文大学进行了短暂的糖尿病治疗方面的研究(合作导师 Prof. Gang Xu)。2012年受聘南方科技大学,建立了以研究细胞-基质黏附和细胞运动为中心的研究实验室。目前的研究主要通过细胞生物学(例如基于荧光技术的活细胞成像)和生物化学方法揭示细胞黏附、伸展和迁移的调控机制, 增进对肿瘤、纤维化疾病等疾病发生发展的认识。

个人简介

研究领域

本实验室主要的研究兴趣是细胞-基质黏附调控细胞运动、细胞生长的机制,目前正在开展的课题包括:

细胞-基质黏附调控细胞运动的机制。 整合素(integrin)介导的细胞-基质黏附是细胞感受细胞微环境(基质)的重要信号通路。异常的细胞-基质黏附与肿瘤转移等恶性疾病密切相关。基于前人在模式生物和其他真核细胞的研究,已发现许多多整合素相关的关键蛋白或蛋白复合物,如FAK、talin、kindlin、ILK-PINCH-parvin、RSU1等。

Kindlin是调控整合素活化的重要蛋白家族,包括三个成员,kindlin-1、-2、-3。Kindlin介导整合素“由内向外”(”inside-out“)信号起始,此外,还介导整合素“由外向内”(outside-in)信号传递。最近的研究中我们发现kindlin缺失抑制细胞-基质黏附(黏焯斑)解聚,影响细胞运动的协调,从而使得细胞运动的方向性变差。我们发现kindlin-2与MLCK相互作用,调控细胞的收缩力(actomyosin contractility)。通过单分子生物传感器,我们测量黏着斑的受力情况,提示了kindlin-2在肌球蛋白收缩力的局部调控中发挥作用。我们将深入研究kindlin对细胞群体运动(collective migration)的影响和调控机制,解析细胞-基质黏附如何调控细胞运动。这些研究涉及活细胞动态成像、生物传感器成像分析等。

细胞-基质黏附与肿瘤的发生和发展。在细胞-基质黏附的功能研究方面,细胞-基质黏附与肿瘤发生和发展的关系一直是我们的兴趣所在。众多的研究表明,正常细胞的生长和增值依赖于整合素介导细胞-基质黏附,而肿瘤细胞的生长则不依赖于细胞-基质黏附。我们发现,进化上十分保守的黏着斑蛋白RSU1负调控MEK-ERK信号通路,我们正在从肿瘤发生的基本原理出发,解析RSU1如何抑制MEK-ERK信号传导的分子机制。这些研究涉及生化和细胞生物学分析信号通路变化等。

整合素信号与血管生成。整合素信号传导调控肌动蛋白细胞骨架动态,从而影响相关的组织器官的发育和功能。我们发现,RSU1缺失的小鼠胚胎出现出血、水肿、发育迟缓和晚期胚胎致死表型,提示可能与血管生成或血管发育缺陷有关。我们正在开展血管发生方面的工作,旨在深入研究RSU1相关的功能和分子机制。这些研究涉及动物模型的建立和组织样本的分析。


教学

主讲本科生课程:

分子生物学 (BIO320)

细胞生物学(BIO206)

高级细胞生物学(BIO323)

生命科学概论(BIO102B)

参讲课程

生命科学前沿讲座(BIO308)


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发表论文

publications at SUSTech

1. Wang CD, Guo XF, Wong TCB, Wang H, QI XF, Cai DQ, Deng Y, Zhao H (2019) Developmental expression of three prmt genes in Xenopus. Zool Res. Mar 18;40(2):102-107.

2. Shi Z, Xin H, Tian D, Lian J, Wang J, Liu G, Ran R, Shi S, Zhang Z, Shi Y, Deng Y, Hou C, Chen Y (2019) Modeling human point mutation diseases in Xenopus tropicalis with a modified CRISPR/Cas9 system. FASEB J. Mar 7: fj201802661R. doi: 10.1096/fj.201802661R. [Epub ahead of print]

3. Sun Y, Ding Y, Guo C, Liu C, Ma P, Ma S, Wang Z, Liu J, Qian T, Ma L, Deng Y, Wu C (2019) -Parvin promotes breast cancer progression and metastasis through interaction with G3BP2 and regulation of TWIST1 signaling. Oncogene. Feb 25. doi: 10.1038/s41388-019-0762-1. [Epub ahead of print].

4. Ke M, Liu J, Chen W, Chen L, Gao W, Qin Y, He A, Chu B, Tang J, Xu R, Deng Y#, Tian R# (2018) Integrated and Quantitative Proteomic Approach for Charting Temporal and Endogenous Protein Complexes. Anal Chem. 90: 12574. (# Corresponding author).

5. Li T*, Deng Y*, Shi Y, Tian R, Chen Y, Zou L, Kazi JU, Rönnstrand L, Feng B, Chan SO, Chan WY, Sun J, Zhao H (2018) Bruton's tyrosine kinase potentiates ALK signaling and serves as a potential therapeutic target of neuroblastoma. Oncogene. Jul 16. doi: 10.1038/s41388-018-0397-7. [Epub ahead of print] (*co-first author).

6. Liu W, Zhong X, Cheng L, Wang J, Sun Y, Deng Y#, Zhang ZT# (2018) Cellular and compositional insight into the sludge dewatering process using enzyme treatment. Environ Sci Pollut Res Int. Aug 14. doi: 10.1007/s11356-018-2854-9. [Epub ahead of print] (#Corresponding authors).

7. Guo L, Cai T, Chen K, Wang R, Wang J, Cui C, Yuan J, Zhang K, Liu Z, Deng Y, Xiao G, Wu C (2018) Kindlin-2 regulates mesenchymal stem cell differentiation through control of YAP1/TAZ. J Cell Biol. 217: 1431.

8. Li H*, Deng Y*, Sun K, Yang H, Liu J, Wang M, Zhang Z, Lin J, Wu C, Wei Z, Yu C (2017) Structural basis of kindlin-mediated integrin recognition and activation. Proc Natl Acad Sci USA. 114: 9349. (*Co-first authors).

9. Liu Z, Kwan T, Cheng, Shi Z, Liu Z, Lei Y, Wang C, Shi W, Chen X, Qi X, Cai D, Feng B, Deng Y, Chen C and Zhao H (2016) Efficient genome editing of genes involved in neural crest development using the CRISPR/Cas9 system in Xenopus embryos. Cell Biosci. 6: 22.

10. Wang C, Kam RK, Shi W, Xia Y, Chen X, Cao Y, Sun J, Du Y, Lu G, Chen Z, Chan WY, Chan SO, Deng Y, Zhao H (2015) The Proto-oncogene Transcription Factor Ets1 Regulates Neural Crest Development through Histone Deacetylase 1 to Mediate Output of Bone Morphogenetic Protein Signaling. J Biol Chem. 290: 21925.

11. Shi W, Xu G, Wang C, Sperber SM, Chen Y, Zhou Q, Deng Y#, Zhao H# (2015) Heat Shock 70-kDa Protein 5 (Hspa5) Is Essential for Pronephros Formation by Mediating Retinoic Acid Signaling. J Biol Chem. 290:577. (#Co-corresponding authors).

12. Lei Y, Guo X, Deng Y, Chen Y, Zhao H (2013) Generation of gene disruptions by transcription activator-like effector nucleases (TALENs) in Xenopus tropicalis embryos. Cell Biosci. 3: 21.

13. Kang ZF, Deng Y, Zhou Y, Fan RR, Chan JC, Laybutt DR, Luzuriaga J, Xu G (2013) Pharmacological reduction of NEFA restores the efficacy of incretin-based therapies through GLP-1 receptor signalling in the beta cell in mouse models of diabetes. Diabetologia 56: 423.

14. Lei Y, Guo X, Liu Y, Cao Y, Deng Y, Chen X, Cheng CH, Dawid IB, Chen Y, Zhao H (2012) Efficient targeted gene disruption in Xenopus embryos using engineered transcription activator-like effector nucleases (TALENs). Proc Natl Acad Sci USA. 109: 17484.

publications prior to SUSTech

15. Kam RK, Deng, Y, Chen Y, Zhao H (2012) Retinoic acid synthesis and functions in early embryonic development. Cell Biosci. 2: 11.

16. Deng Y, Guo Y, Watson H, Au WC, Shakoury-Elizeh M, Basrai MA, Bonifacino JS, Philpott CC (2009) GGA2 mediates sequential ubiquitin-independent and -dependent steps in the trafficking of ARN1 from the trans-golgi network to the vacuole. J Biol Chem. 284: 23830.

17. Deng Y, Golinelli-Cohen M, Smirnova E, and Jackson CL (2009) A COPI coat subunit interacts directly with an early-Golgi localized Arf Exchange Factor. EMBO Rep. 10: 58.

18. Kim Y*, Deng Y*, Philpott CC (2007) GGA2- and Ubiquitin-dependent Trafficking of Arn1, the Ferrichrome Transporter of Saccharomyces cerevisiae. Mol Biol Cell. 18: 1790. (* co-first author).

19. Deng Y, Schmidtmann A, Kruse S, Filatov V, Heilmeyer LM Jr, Jaquet K Thieleczek (2003) Phosphorylation of human cardiac troponin I G203S and K206Q linked to familial hypertrophic cardiomyopathy affects actomyosin interaction in different ways. J Mol Cell Cardiol. 35: 1365.

20. Wang JX, Zhao XF, Deng Y, Qi HY, Wang ZJ (2003) Chromosomal polymorphism of mandarin vole, Microtus mandarinus (Rodentia). Hereditas 138: 47.

21. Wang JX, Zhao XF, Koh HS, Deng Y, Qi HY (2003) Chromosomal polymorphisms due to heterochromatin growth and pericentric inversions in white-bellied rat, Niviventer confucianus, from China. Hereditas 138: 59.

22. Deng Y, Schmidtmann A., Redlich A., Westerdorf B., Jaquet K, Thieleczek R (2001) Effects of Phosphorylation and Mutation R145G on Human Cardiac Troponin I Function. Biochemistry 40: 14593.

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南科大生物系成立于2012年,在短短7年多时间里,吸引了一批海内外高尖端人才加盟,已初步建成了以资深教授领军,科研活跃和发展势头强劲的副教授为中坚力量,年轻助理教授为前锋的一支国际化高水平的教研序列队伍。生物系引进的教授序列全部具有博士学位,毕业于国际一流大学,在海外知名大学或研究机构从事过博士后研究,或在国际一流大学获得教职。其中的资深教授在加入南科大之前已经在境外著名高校或科研机构获得了终身教授的职位。此外,南方科技大学生物系还吸引了以年轻的博士、博士后组成的工程师团队辅助教学和科研工作的展开。教学与科研辅助人员逾300人。研究方向涵盖分子细胞生物学、神经生物学、植物生物学、系统生物学、结构生物学等领域,侧重生命科学前沿领域的基础研究以及与生命科学相关的应用基础研究,积极鼓励学科交叉。
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